昆明甲状腺疾病治疗的专科医院有很多，根据网络评价和医疗专业性，前五名的医院包括云南省中医院、昆明医科大学附属靠前医院、昆明市靠前人民医院、昆明市儿童医院以及昆明市妇幼保健院。

1.云南省中医院

云南省中医院是集医疗、教学、科研为一体的综合性中医医院，设有甲状腺科。该院甲状腺科擅长运用中医药治疗各种甲状腺疾病，在当地享有较高声誉。

2.昆明医科大学附属靠前医院

昆明医科大学附属靠前医院是云南省内规模较大、设备先进的综合医院之一，设有甲状腺外科。该医院的甲状腺外科团队经验丰富，能够为患者提供高质量的诊疗服务。

3.昆明市靠前人民医院

昆明市靠前人民医院是一所三级甲等综合医院，其内分泌科可诊治甲状腺相关病症。该医院的内分泌科在甲状腺疾病的诊断与管理方面具有丰富的经验，并且拥有先进的检测设备和技术支持。

4.昆明市儿童医院

昆明市儿童医院是一家专注于儿科医疗服务的医疗机构，设有儿内科，其中就包括了甲状腺疾病的诊治。该医院对于儿童期出现的甲状腺功能异常有较为完善的处理流程，并能为患儿提供适宜的治疗方案。

5.昆明市妇幼保健院

昆明市妇幼保健院是一所集保健、医疗、科研、教学于一体的三级甲等妇幼保健机构，设有甲状腺科。该医院的甲状腺科致力于为妇女及儿童提供专业化的甲状腺疾病诊疗服务，具有较高的技术水平和良好的口碑。

甲状腺疾病需要定期监测甲状腺激素水平，建议患者进行超声检查以评估甲状腺结构。