济宁男科医院排行榜中，山东省中医药大学附属医院、济宁医学院附属医院、济宁市靠前人民医院、济宁市中医院、济宁市第二人民医院都是治疗男科疾病的不错选择。患者可根据自身情况和需求选择合适的医院进行治疗。

1.山东省中医药大学附属医院

山东省中医药大学附属医院是集医疗、教学、科研于一体的三级甲等中医医院。该院设有男科，擅长运用传统中药及针灸疗法治疗男性疾病，在勃起功能障碍、早泄等领域具有一定的优势。

2.济宁医学院附属医院

济宁医学院附属医院是一所综合性三级甲等医院，设有泌尿外科和男科。该医院的泌尿外科和男科在前列腺增生、膀胱癌等疾病的诊治方面积累了丰富的经验，且拥有先进的设备和技术支持。

3.济宁市靠前人民医院

济宁市靠前人民医院是一家三级甲等综合医院，设有泌尿外科和男科。该医院的泌尿外科和男科在输精管堵塞、睾丸扭转等方面有较高的技术水平和丰富的临床经验。

4.济宁市中医院

济宁市中医院是一所集医疗、教学、科研为一体的大型中医医院，设有男科。该医院的男科以中医药治疗为主，擅长运用中药内服外敷、针灸推拿等方法治疗男性不育、阳痿等问题，具有独特的疗效。

5.济宁市第二人民医院

济宁市第二人民医院是一所三级乙等综合医院，设有泌尿外科和男科。该医院的泌尿外科和男科在包皮过长、阴茎异常勃起等方面的诊疗技术较为成熟，能够为患者提供专业的服务。

选择治疗男科疾病的医院时，应考虑医院的专业水平和服务质量。同时，建议患者在就医前进行相关检查，如血液检测、超声波检查等，以便医生准确诊断病情并给予合适的治疗方案。