十三岁女孩患有卵巢囊肿时，需要考虑是否为功能性囊肿、子宫内膜异位囊肿等良性疾病，必要时可通过超声波检查明确诊断。

由于患者体内激素水平的变化，可能会导致卵泡膜细胞黄体化，进而引发上述病症。通过超声波检查可以观察到囊肿的位置、大小以及内部结构，有助于确诊。此外，医生还可能会建议进行肿瘤标志物检测，如CA125和HE4，以辅助诊断。

如果囊肿体积较大或伴有疼痛等症状，则可能需要手术治疗，如腹腔镜下卵巢囊肿剔除术。

针对卵巢囊肿的诊治需注意避免过度的精神压力，并保持良好的生活习惯，定期复查以监测病情变化。