小儿疱疹性咽峡炎反复发烧的恢复时间因个体差异而异，通常在3-5天内好转。重症或有并发症者，发烧时间可能会延长。

小儿疱疹性咽峡炎是由肠道病毒感染引起的急性上呼吸道感染，主要通过粪-口途径传播，临床上以发热、咽痛、口腔疱疹等为主要特征。该疾病通常为自限性疾病，患儿的免疫状态良好，没有其他基础疾病，且没有并发症，此时病情恢复较快，通常3-5天内可以退热。

如果患儿存在免疫缺陷或其他基础疾病，如糖尿病、心血管疾病等，可能会影响疾病的恢复进程，导致发烧时间延长。

在治疗期间，应密切监测患儿的体温变化，避免剧烈运动，保证充足的休息，以促进身体恢复。