上海交通大学医学院附属瑞金医院、上海长海医院、上海仁济医院、上海长征医院、上海东方肝胆外科医院是上海市治疗甲状腺疾病的专科医院，这些医院在甲状腺疾病的诊断和治疗方面具有较高的专业水平和丰富的经验。

1.上海交通大学医学院附属瑞金医院

上海交通大学医学院附属瑞金医院是综合性的三级甲等医院，在甲状腺疾病诊疗方面具有较高的声誉。该医院拥有先进的设备和技术力量雄厚的医疗团队，能够为患者提供高质量的甲状腺疾病诊治服务。

2.上海长海医院

上海长海医院是一所集医疗、教学、科研于一体的综合性三甲医院，其甲状腺科在国内享有较高声誉。医院拥有一支经验丰富的专家队伍，他们熟练掌握各种甲状腺疾病的诊断与治疗方法，能够为患者提供专业、规范的医疗服务。

3.上海仁济医院

上海仁济医院是一家大型的综合性医院，其甲状腺科在华东地区有着较高的知名度和影响力。该科室拥有一批技术精湛、经验丰富的医生团队，他们在甲状腺疾病的诊断、治疗及研究等方面处于国内领先水平。

4.上海长征医院

上海长征医院是卫生健康委员会指定的全国疑难重症诊治指导中心之一，其甲状腺科在业内颇具实力。该科室引进了国内外较先进的诊疗技术和设备，同时不断开展新技术新项目，以满足不同患者的个性化需求。

5.上海东方肝胆外科医院

上海东方肝胆外科医院是国内著名的肝胆胰疾病诊治中心，同时也擅长甲状腺疾病的诊治。该医院汇聚了一批高水平的医学专家，他们在甲状腺疾病的诊断与治疗方面积累了丰富的经验，并且紧跟国际前沿技术发展动态，不断提升自身的技术水平。

选择合适的医院进行甲状腺疾病的诊治至关重要。建议患者在就医前详细了解各医院的相关信息，包括设备设施、技术水平以及服务质量等，以便做出更为明智的决策。