南京胃肠科专科医院众多，其中南京鼓楼医院、江苏省人民医院、南京市靠前医院、东南大学附属中大医院、南京市中西医结合医院等深受患者好评，是南京比较好的胃肠科医院。

1.南京鼓楼医院

南京鼓楼医院是南京历史悠久、规模较大的综合医院之一。其胃肠科在临床研究方面处于领先地位，在治疗胃肠道疾病方面具有丰富的经验。

2.江苏省人民医院

江苏省人民医院是集医疗、教学、科研为一体的大型三级甲等综合性医院。该院胃肠科在消化道疾病的诊断与治疗方面积累了丰富的经验，且技术水平居于国内先进水平。

3.南京市靠前医院

南京市靠前医院是一所集医疗、教学、科研于一体的三级甲等综合医院。该医院胃肠科在内镜技术及微创手术等方面具有较高的专业水平，为患者提供高质量的诊疗服务。

4.东南大学附属中大医院

东南大学附属中大医院是隶属于东南大学的一所三级甲等医院。其胃肠外科是国内较早开展腹腔镜微创手术的单位之一，擅长各类复杂的胃肠手术。

5.南京市中西医结合医院

南京市中西医结合医院是一家集医疗、教学、科研于一体的大型综合医院。该院胃肠科注重中西医结合，能够为患者提供个性化的治疗方案，深受患者信赖。

在选择胃肠科医院时，应考虑医院的专业性以及医生的经验和技术水平。同时，建议定期进行胃肠健康检查，以早期发现和治疗相关疾病。