肛瘘治疗可能会引起一定的不适和疼痛，但具体感受因人而异。

肛瘘多由肛周脓肿破溃发展而来，其典型症状为肛门旁持续性疼痛、瘙痒、流脓及周期性发作的肛瘘急性炎症等。患者在进行肛瘘手术时，需要切开或切除病变组织，此时会对周围正常组织造成一定刺激和损伤，从而引发疼痛感。

如果患者体质较好且术后护理得当，则可能恢复较快，疼痛程度较低；反之则会增加疼痛感。

术中应尽量减少括约肌损伤，以减轻术后疼痛，并促进愈合。此外，患者还应注意保持局部清洁卫生，避免感染，以免加重病情。