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药学部是集药品采购、供应、调剂、制剂、临床药学、教学工作及贯彻执行药政法规为一体，多功能、性质特殊、任务繁杂的科室。药学部下设二级科室：门诊药房、住院药房、药库、制剂室、临床药学室，主要职责：保障全院临床、医技科室药品供应，促进安全、有效、经济、合理用药。药学部目前有员工51人，其中副主任药师1人、主管药师10人、主管中药师5人，药师19人、中药师5人，中、西药士6人。临床药学科：开展合理用药评价、超常用药预警与分析、抗菌药物控制指标等药学控制指标的分析，药师查房、医嘱审核、院内会诊等工作，极大地促进了临床合理用药整体水平的提高，每月出《药物警戒线》一期，药事管理月报一份。药品调剂科：是集药品供应、调剂、药学实践教育及药学教学为一体的业务科室。负责全院门诊及各病区所有病房的药品供应和管理。制剂室:符合GPP要求的现代化制剂室，位于药剂楼的一层和二层，一层以中药提取为主，二层设有内服制剂、外用制剂、理化检验室、微生物检验室和制剂成品库等。拥有一大批先进的制剂设备，如中药提取浓缩罐机组、旋转式压片机、摇摆式颗粒机、胶囊连体套合机、全自动中药制丸机、片剂四用测定仪、药品稳定性试验箱、高效液相色谱仪（单泵标准配置）、高性能气相色谱仪等。同时按GPP要求建立了设备管理的各项规章制度和标准操作规程。能生产颗粒剂、片剂和栓剂，并可临方炮制。医院现开展剂型有片剂、颗粒剂、栓剂、散剂等，临床使用制剂19个，其中四川省食品药品监督管理局的核准品种7个，其余12个为临床协定处方。我院制剂质量稳定、临床使用安全、疗效显著、价格合理，深受患者好评。2013年，成食药监【2013】32号文件将我院7个品种制剂纳入全市调剂使用的医疗机构中药制剂目录，同年7个品种全部纳入医保用药。