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第一医院儿科组建于1971年，初期床位36张，历经7任科主任的带领下，积累了深厚的科室文化底蕴并逐步发展成今天全省规模最大的三级甲等医院综合儿科专科床位133张。目前拥有71名儿科医生，护理人员名160名。其中32名高级职称以上医生，38名硕士、8名博士，先后巳有10名医务人员出国研修。

是“中华医学会儿科分会委员、中国医师协会儿科分会常委、福建医学会儿科分会副主任委员，厦门医学会儿科主任委员”等成员单位；是“卫生部儿科重症国家临床重点专科、福建省儿科重点专科、厦门市卫计委儿科重点专科”单位；拥有“国家儿科临床药物试验基地、卫计委国家儿科专科医师培训基地、美国心脏协会（AHA）心血管急救培训中心”等基地。2015年与厦门大学医学院共同成立儿科转化医学实验室，同年获国家发改委厦门现代综合服务项目建设经费400万元，配套经费2000万元，用于开发儿科大数据智能化信息服务平台。2016年获批“厦门大学医学院儿童医学研究所”；2017年获批“厦门儿童医学中心”。

儿科率先在厦门地区开展“儿童连续性血液净化、脑氧监护技术、营养代谢监测、儿童纤维支气管镜诊疗、儿童喉咽返流检测”等一大批新技术，已成功应用于脓毒性休克、溶血性疾病、ARDS、MODS、重度脑损伤等急危重症疾病的救治，以及疑难呼吸系统等疾病的诊治，已系统开展临床大数据分析、基础科学研究，建立起医疗、教学、科研相结合的一体化儿科诊疗平台。