会厌囊肿通常不会发生癌变。

会厌囊肿是由于会厌黏膜下的腺体发育异常或者黏膜受到创伤后形成的良性病变，这种疾病的发生与基因突变无关，因此很少有恶变的风险。但是，如果患者出现吞咽困难、呼吸急促等症状时，应及时就医以免延误病情。

会厌囊肿还可能伴随感染或形成急性炎症反应，若未经及时治疗，可能导致局部组织坏死，进而增加癌变风险。

会厌囊肿是一种常见的良性疾病，但需要定期复查以监测其大小和形态变化。对于存在上述高危因素的人群，建议定期进行咽喉部检查以及生活习惯调整，如戒烟限酒等，以降低癌变风险。