十三岁男孩拉肚子水样稀便黄色可能是由消化系统感染引起的。

消化系统感染是由病原体侵入肠道所致，这些病原体会刺激肠道产生炎症反应，导致肠道蠕动加快，从而使食物未经充分消化就排出体外，表现为水样稀便。同时，炎症还可能导致肠道黏膜脱落，血液进入肠道，使粪便呈现黄色或带血丝。

如果症状持续超过24小时或伴有高热（体温超过38.5℃）、呕吐、腹痛等症状时，需考虑急性胃肠炎的可能性。

在治疗期间，应避免食用油腻、辛辣或难以消化的食物，以减少胃肠道负担，并促进身体康复。