软腭囊肿通常不会自行消失。

软腭囊肿是由于上皮组织异常增生引起的，这种异常增生的情况并不会随着病情的发展而自行消退，因此该疾病也不会自愈。患者可能会出现吞咽困难、呼吸不畅等症状，严重时甚至可能导致窒息，建议及时进行专业治疗。

此外，如果囊肿体积较大或伴有感染，可能需要手术切除。

针对软腭囊肿的治疗需谨慎处理，避免因不当处理导致并发症的发生，同时应注意保持口腔卫生，定期复查以监测病情变化。