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李青娇

李青娇

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出诊地点: 中山大学附属第八医院 医学研究中心

执业经历: 博士,副研究员,中山大学硕士研究生导师,中山大学“百人计划”引进人才,深圳市海外高层次C类人才,福田英... [详细介绍 ]

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中山大学附属第八医院 - 医学研究中心
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医生介绍
医生简介

博士,副研究员,中山大学硕士研究生导师,中山大学“百人计划”引进人才,深圳市海外高层次C类人才,福田英才III类人才。分别于2009年和2011年在武汉大学计算机学院获学士和硕士学位,于2016年和2017年在美国南加利福尼亚大学(USC)获统计硕士学位和计算生物系博士学位,后于美国加州大学洛杉矶分校(UCLA)从事博士后研究。

主要研究领域:生物信息学、液体活检和肿瘤精准医疗。在中山大学附属第八医院组建了临床生物信息实验室,搭建高性能并行计算平台,具有处理大量高通量测序数据并进行大数据挖掘的能力;搭建液体活检实验平台,具有从临床取样、质控、样本处理、遗传物质提取和高通量建库等能力。

联系邮箱:liqj23@mail.sysu.edu.cn

主持的项目:

国家自然基金青年项目(项目号:32000466):外周血cfDNA甲基化测序数据分析方法及其在癌症辅助诊断中的应用,2021.01-2023.12,24万元,主持。广东省基础与应用基础研究基金项目区域联合基金-青年基金项目(项目号:2019A1515111174):基于外周血循环RNA的肺癌早期无创诊断研究, 2020.01-2022.12,10万,主持。深圳市科创委基础研究面上项目(项目号:JCYJ20190808100817047):基于外周血 DNA甲基化的胎儿生长受限孕早中期预测模型构建,2020.08-2023.08,20万,主持。深圳市优秀科技创新人才培养项目-博士基础研究启动项目(项目号:RCBS20200714114909234),基于人工智能技术开发联合外周血循环DNA和RNA的胰腺癌早期无创诊断方法研究, 2021.04-2024.04, 20万,主持。中山大学青年教师培育项目(项目号:19ykpy02):基于循环DNA甲基化测序数据的肺癌精准医疗研究,2019.01-2021.06,15万,主持中山大学附属第八医院杰出青年后备人才项目(项目号:FBJQ2019004):基于外周血甲基化测序数据的肺腺癌伴随诊断研究,2019.01-2021.12,36万,主持

代表性论文:

Del Vecchio G†, Li Q†, Li W†, Thamotharan S, Tosevska A, Morselli M, Sung K, Janzen C, Zhou X*, Pellegrini M*, Devaskar SU*. Cell-free DNA Methylation and Transcriptomic Signature Prediction of Pregnancies with Adverse Outcomes. Epigenetics. 2020 Oct 13:1-20.Guo Y*, Huang Z, Sang D, Gao Q, Li Q*. The Role of Nutrition in the Prevention and Intervention of Type 2 Diabetes. Front Bioeng Biotechnol. 2020 Sep 15;8:575442. Zhang R, Chen J, Mao L, Guo Y, Hao Y, Deng Y, Han X, Li Q*, Liao W*, Yuan M*: Nobiletin Triggers Reactive Oxygen Species-Mediated Pyroptosis through Regulating Autophagy in Ovarian Cancer Cells. J Agric Food Chem 2020, 68:1326-1336.Li W†, Li Q†, Kang S, Same M, Zhou Y, Sun C, Liu C-C, Matsuoka L, Sher L, Wong WH, et al: CancerDetector: ultrasensitive and non-invasive cancer detection at the resolution of individual reads using cell-free DNA methylation sequencing data. Nucleic Acids Research 2018, 46(15). Li Q†, Tjong H†, Li X, Gong K, Zhou XJ, Chiolo I, Alber F: The 3D genome organization of Drosophila melanogaster through data integration. Genome Biology 2017, 18(1): 145. Kang S, Li Q, Chen Q, Zhou Y, Park S, Lee G, Grimes B, Krysan K, Yu M, Wang W, Alber F, Sun F, Dubinett S, Li W, Zhou XJ: CancerLocator: Non-Invasive Cancer Diagnosis and Tissue-of-Origin Prediction Using Methylation Profiles of Cell-Free DNA. Genome Biology 2017, 18(1): 53.
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