生殖器疱疹患者可以遵医嘱使用碘伏进行消毒。

碘伏是一种外用的广谱杀菌剂，具有抗菌、抗病毒的作用，能够有效地杀灭多种细菌及真菌，包括常见的金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌等，以及某些类型的疱疹病毒，如1型和2型单纯疱疹病毒。因此，对于患有生殖器疱疹的患者而言，碘伏是一个安全有效的消毒选择。

在感染初期或有皮肤破损时，应避免使用碘伏以防刺激伤口或影响病情观察。

患者在治疗期间应注意个人卫生，保持患处干燥清洁，避免过度摩擦或挤压病变部位，以减少继发感染的风险。