咽喉黏膜囊肿通常并不严重，也不会发生癌变。

咽喉黏膜囊肿主要是由于局部炎症刺激引起的黏膜下腺体堵塞所致，其属于一种良性疾病，并不存在恶性转化的可能性。因此，该病并不会对患者的健康造成太大影响，但若囊肿较大或者伴有感染等问题，则需要及时处理以减轻症状并预防并发症的发生。

虽然咽喉黏膜囊肿一般不会癌变，但如果存在长期吸烟、酗酒等不良生活习惯或患者本身免疫系统功能低下，可能会增加患癌风险。

在关注咽喉黏膜囊肿的同时，应注意定期复查以及避免吸烟、酗酒等不良习惯，以减少潜在的风险。