无痛人流不会直接伤害子宫内膜，但在操作过程中可能会对子宫内膜造成轻微损伤。

无痛人流通常是在局部麻醉下进行的，医生会使用一种特殊的工具进入子宫腔内，取出孕囊和其他组织。在这个过程中，子宫内膜可能会受到一定的刺激和损伤，但这种损伤通常是暂时的，可以通过身体自身的修复过程得到恢复。因此，在正规医疗机构接受专业医生的操作下，无痛人流并不会直接伤害子宫内膜。

如果术后出现长时间阴道出血、腹痛等症状，则可能是子宫内膜受损或其他并发症的表现，需及时就医处理。

需要注意的是，无论采用何种方式进行人工流产，都会对女性的身体产生一定程度的影响，因此建议采取有效的避孕措施，以减少不必要的风险。