太原治疗胃肠疾病的医院可以考虑山西白求恩医院、山西医科大学靠前医院、山西省人民医院、山西省中医院、山西省肛肠医院。选择具体医院时，应考虑其专业性、设备和技术水平以及患者的个人需求和预算。

1.山西白求恩医院

山西白求恩医院是当地一所知名的综合性医院，对于胃肠疾病的治疗有着丰富的经验。该医院专注于消化系统疾病的研究与诊治，在胃肠病学方面具有较高的专业水平。

2.山西医科大学靠前医院

山西医科大学靠前医院为患者提供全面的胃肠诊疗服务，包括内镜检查、手术等。医院拥有先进的医疗设备及专业的胃肠科团队，能够有效地诊断和治疗各种胃肠疾病。

3.山西省人民医院

山西省人民医院针对多种胃肠道疾病提供全方位的医疗服务，如慢性胃炎、溃疡性结肠炎等。该机构致力于开展胃肠功能研究，旨在提高对这些复杂病理过程的理解，进而改善患者的预后。

4.山西省中医院

山西省中医院将传统中医理念与现代医学技术相结合，为患者提供个性化的肠胃调理方案。该机构擅长运用中药外敷、针灸等方法来缓解腹痛、腹泻等症状，有助于促进机体康复。

5.山西省肛肠医院

山西省肛肠医院是一家专注于肛肠疾病诊治的专科医院，同时也收治部分胃肠疾病患者。该医院以中西医结合的方式治疗各类肛门、直肠及结肠疾患，并且注重预防保健工作。

在选择胃肠治疗时，应考虑上述提及的医院，同时建议定期进行胃肠镜检查以及注意饮食卫生。