深圳那个男科医院治疗的比较好可以考虑北京大学深圳医院、深圳市第二人民医院、深圳市人民医院、深圳市中医院、深圳市妇幼保健院等，这些医院都在深圳排行前三名。选择哪家医院就诊可以根据自己的具体情况和需求进行考虑。

1.北京大学深圳医院

北京大学深圳医院是深圳市的一家大型综合医院，设有男科诊疗科室。该医院的男科专业领域涵盖泌尿系统疾病、男性生殖健康等方面，在技术和设备方面处于领先地位，能够为患者提供高质量的医疗服务。

2.深圳市第二人民医院

深圳市第二人民医院也是一家综合性医院，拥有专业的男科医生团队和先进的诊疗设施。该医院在男性疾病的诊断与治疗方面积累了丰富的经验，致力于为患者提供全面、个性化的服务。

3.深圳市人民医院

深圳市人民医院是一家三级甲等公立医院，其男科诊疗中心具备完善的设备及技术力量。该医院注重技术创新与应用，不断引进国内外先进疗法和技术手段，以满足不同患者的需求。

4.深圳市中医院

深圳市中医院是一所集医疗、教学、科研于一体的大型中医医院，设有男科门诊。该医院秉承传统中医药文化理念，融合现代医学技术，为患者提供个性化、综合性的男科诊疗服务。

5.深圳市妇幼保健院

深圳市妇幼保健院是一家专注于妇女儿童健康的医疗机构，但同时也提供男科诊疗服务。该医院关注整体健康，强调预防为主，通过科学管理、规范操作来保障医疗质量，深受患者信赖。

选择男科医院时需考虑个人实际情况及预算，同时建议关注医院的专业性及口碑评价。