南京医科大学靠前附属医院、南京鼓楼医院、南京市中西医结合医院、东南大学附属中大医院、南京军区南京总医院这五家胃肠医院在南京的前五名中。

1.南京医科大学靠前附属医院

南京医科大学靠前附属医院是南京地区知名的综合性医疗机构，在胃肠疾病治疗方面具有较高的声誉。该医院拥有一支经验丰富的胃肠科医疗团队，能够为患者提供专业的诊断和治疗服务。

2.南京鼓楼医院

南京鼓楼医院是一家历史悠久、设备先进的三级甲等综合医院，其胃肠外科在国内享有较高声誉。该医院的胃肠外科团队在腹腔镜手术、内窥镜检查等方面处于领先地位，可为患者提供微创、精准的诊疗方案。

3.南京市中西医结合医院

南京市中西医结合医院是一所集医疗、教学、科研于一体的大型中医医院，设有独立的消化内科科室。该医院将传统中医药疗法与现代医学技术相结合，为胃肠道疾病的诊治提供了独特的视角和手段。

4.东南大学附属中大医院

东南大学附属中大医院是江苏省重点建设的三级甲等综合性医院，设有完善的消化内科专业科室。该医院的消化内科致力于开展各种胃肠病的临床研究工作，以提高对这些疾病的了解和认识。

5.南京军区南京总医院

南京军区南京总医院是隶属于中国人民解放军的一家三甲级综合医院，其消化内科在军内外享有较高知名度。该医院的消化内科拥有先进的诊疗设备和技术，能够有效地解决各类胃肠系统相关的问题。

选择胃肠医院时，应考虑医院的专业水平及服务质量，同时关注是否有先进的诊疗设备以及是否具备处理复杂病例的能力。