甲状舌管囊肿硬化治疗后仍有疙瘩时，可考虑囊肿切除术、中药外敷、消炎止痛药物、甲状腺功能监测、颈部超声检查等治疗方法。

1.囊肿切除术

囊肿切除术通过手术直接移除病变组织，以达到治愈的目的。对于经过药物治疗无效且确诊为甲状舌管囊肿的患者而言，此方法是优选方案。

2.中药外敷

中药外敷可以促进局部血液循环，缓解术后疼痛及肿胀。适用于囊肿较大、伴有明显不适症状但不愿接受手术者。

3.消炎止痛药物

消炎止痛药物可减轻术后炎症反应引起的不适感。对于存在轻微疼痛或感染迹象但无需立即手术者有益。

4.甲状腺功能监测

甲状腺功能监测有助于评估囊肿对甲状腺的影响及恢复情况。在囊肿切除前后定期进行，以确保甲状腺功能正常。

5.颈部超声检查

颈部超声检查是一种无创性诊断手段，能够清晰地显示颈部结构，辅助判断囊肿是否完全摘除。在治疗前后常规进行，以便及时发现复发或其他相关问题。

在接受甲状舌管囊肿硬化治疗后发现残留疙瘩时，应避免自行挤压或搔抓，以免引起感染。同时建议定期复查，以便及时发现并处理任何异常情况。