肛瘘术后小便出血可能与手术创伤、凝血功能异常或尿路感染等因素有关。

肛瘘手术会涉及切开或切除受影响区域的皮肤及软组织，此时会导致局部毛细血管破裂，引起小便出血的现象。如果患者本身存在凝血功能障碍或凝血因子缺乏等问题，在进行肛瘘手术后可能会加重出血症状。另外，若未做好术后的个人护理工作，导致细菌侵入尿道口周围，诱发尿路感染，则会引起炎症反应，从而发生上述现象。

此外，还应考虑是否存在痔核脱落引起的少量出血，建议观察是否有疼痛感以及伴随症状以确定具体原因。

术后患者应注意保持伤口干燥清洁，避免剧烈运动，以免影响伤口愈合和身体恢复。同时还要注意多喝水，适当增加膳食纤维摄入量，促进排便顺畅。