肛瘘患者在排便时可能会感到疼痛，因为粪便通过瘘管刺激炎症区域。

由于肛瘘存在一个瘘管与肛门相通，当患者进行排便时，坚硬或较多的粪便经过瘘管时会对受损的肛门黏膜产生摩擦和压迫，进而引发或加重疼痛感。这种疼痛可能伴有瘙痒、分泌物增多等不适症状，严重者甚至会出现排便困难的情况。因此，对于患有肛瘘的患者来说，在日常生活中应特别注意保持良好的排便习惯，以减轻症状并促进康复。

如果患者处于急性期或者出现并发症，如感染扩散到周围组织，则排便时的疼痛程度会相应增加。

在诊断为肛瘘后，患者应及时就医接受专业治疗，以免病情恶化导致复杂性肛瘘的发生。同时，保持局部清洁干燥，避免使用刺激性强的洗液，以减少不适症状。