肛瘘手术一般不会留下明显的后遗症。

肛瘘手术旨在移除瘘管及感染源，恢复正常解剖结构，减少复发风险。虽然存在一定的并发可能性，但及时发现和处理可以有效降低后遗症发生率。

术后可能出现疼痛、出血、尿潴留等不适症状，可能与局部组织损伤有关。

在进行肛瘘手术时，应严格遵循医嘱，避免并发症的发生，并注意术后伤口护理及定期复查。