肛瘘术后两个月胀痛可能是术后并发症引起的，如切口感染、皮下积液等。

肛瘘术后两个月胀痛主要是因为术后切口感染引起局部炎症反应，导致组织水肿和渗出，从而引发胀痛的症状。皮下积液则是因为术后淋巴循环受阻或者局部血液循环不畅所致，液体在组织间隙中积聚，压迫周围神经末梢，产生胀痛感。这些并发症需要及时处理，以免影响伤口愈合及身体健康。建议患者及时复诊，以便进行相应检查和治疗。

此外，如果疼痛伴有发热、寒战等症状，则可能表明存在术后感染，需使用抗生素治疗，如头孢曲松钠、克林霉素等；若疼痛持续且无法通过简单措施缓解，则应考虑是否存在血肿或脓肿形成，必要时需手术引流。

术后患者应注意保持肛门部位清洁干燥，避免久坐硬板凳，以减少不适症状的发生。同时还要调整饮食结构，尽量食用易消化的食物，如小米粥、软面条等，有利于促进身体恢复。