肛瘘术后疼痛可以遵医嘱服用非甾体抗炎药来缓解不适症状，如双氯芬酸钠肠溶片、塞来昔布胶囊等。

上述两种药物均具有解热镇痛的作用，能够抑制前列腺素合成，从而达到止痛的目的。但需注意的是，在使用过程中要遵循医嘱，不可随意增减剂量，以免引起不良后果。此外，若疼痛持续不缓解或者加剧，应及时告知医生以便调整治疗方案。

患者还可考虑应用利多卡因胶浆或贴敷丁卡因酯膏于患处以减轻切口部位的刺激性疼痛。这两种药物均为麻醉剂，可暂时阻断神经传导，起到局部止痛的效果。

术后患者应避免剧烈运动，以免加重伤口疼痛，影响愈合，并且还要保持良好的排便习惯，预防便秘的发生。