肛瘘的手术一般会感到疼痛。

肛瘘的手术需要切开或移除瘘管及相关组织，对肛门周围区域造成创伤，引起局部炎症反应和神经反射，从而导致疼痛感。

如果患者选择的是微创手术，则术后疼痛程度通常较轻，因为这种手术方式造成的损伤较小，因此患者的痛苦也相对较低。

在实施肛瘘手术时，应考虑使用镇痛药物以减轻患者不适，并且术后需注意伤口护理及排便管理，以减少感染风险和促进愈合。