包茎上面的小水泡伴有瘙痒和疼痛，考虑为龟头炎所致。

龟头炎是指龟头部由外伤、刺激或感染引起的炎症反应，可表现为局部红斑、水肿、糜烂及溃疡形成，当病情发展到一定程度时，会出现小水泡的现象。该病主要由细菌或真菌感染引起，如金黄色葡萄球菌、白色念珠菌等，这些致病菌在局部繁殖会引发免疫应答，产生炎症反应，从而出现瘙痒和疼痛的感觉。

此外，还可能是摩擦损伤、接触性皮炎、生殖器湿疹等情况导致的。因为包茎患者在日常生活中容易因尿液刺激而发生炎症，所以要特别注意个人卫生。

建议患者定期清洗患处，并保持干燥清洁，避免使用刺激性强的洗剂。同时还要勤换内裤，尽量选择宽松透气的棉质内裤，以减少摩擦和汗液刺激。