怀孕卵巢囊肿部分可以自行消失，但并非所有囊肿都会自然消退，具体取决于囊肿类型及大小。

孕期卵巢囊肿的发生与体内雌激素和孕激素比例失调有关，可能导致子宫内膜异位症。小的生理性囊肿通常会随着孕期结束而自行消失，因为它们是由卵泡发育不完全引起的暂时性病变。但是，如果囊肿较大或为病理性囊肿，则不会自行消失，需要通过手术切除。

因此，对于孕期卵巢囊肿，建议定期监测其大小和性质，以便及时发现异常情况并采取适当措施。

对于较大的、复杂的或者有症状的囊肿，可能需要在专业医生指导下使用黄体酮等药物进行保守治疗，以促进其缩小或稳定。

孕期女性应注意关注自身身体变化，特别是在发现卵巢囊肿后，应避免剧烈运动，以免加重病情。同时，保持良好的生活习惯，均衡饮食，有助于减少卵巢囊肿的发生。