尖锐湿疣三个月后发病严重可能是由于病毒复制活跃、免疫反应减弱等原因导致的。

尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起的性传播疾病，具有一定的潜伏期，在潜伏期内病毒会持续繁殖，但并不引起明显的症状。当病毒繁殖到一定数量时，才会出现典型的临床表现，如生殖器上出现小而柔软的突起，表面不规则，呈粉红色或灰色，有时伴有瘙痒或疼痛感。此时患者的免疫系统正在与病毒进行斗争，但由于病毒已经高度繁殖，所以会导致病情迅速发展，形成更大的疣体。因此，对于尖锐湿疣的诊断和治疗，需要综合考虑潜伏期和临床表现，及时采取有效的抗病毒治疗措施，以控制病情进展。

此外，若患者在感染期间使用了免疫抑制剂或患有糖尿病等慢性疾病，可能会影响机体的免疫应答能力，从而延缓尖锐湿疣的症状出现，使病情看起来似乎比实际更轻微。

针对尖锐湿疣的治疗，需注意避免过度搔抓患处以防继发感染，并定期复查以监测病情变化。同时，建议患者遵循医嘱完成整个疗程的治疗方案，以减少复发风险。