治疗胃及十二指肠溃疡、脾胃不和、萎缩性胃炎、胆汁反流性胃炎、糜烂性胃炎、消化不良、肠胃炎、贲门炎、幽门螺旋杆菌等胃肠系统疾病。

孙晋舟医生主要从事消化系统疾病诊治(消化道早癌、消化道出血、炎性肠病、消化性溃疡及胃食管反流病等)与内镜下微创治疗(放大内镜精查，内镜下黏膜切除术等)，尤其擅长消化道早癌及消化道出血的规范临床诊疗，均积累了丰富临床经验。