各种起博器植入、二尖瓣球囊扩张、射频消融、先心病导管封堵、冠状动脉造影等的诊治。

孙建昌主任是我国最早开展植入式心脏起搏器研制与临床应用的专家之一。曾从事外科临床8年，专门学习过医用电子工程课程，并在德国、美国﹑意大利等国家接受过心脏起搏介入技术的专业培训，是我国目前少有的集外科、电子工程、心内科和心脏起搏介入技术为一身、具有丰富临床经验的心脏病学专家。二十八年来，已为全国各地军内外病人安装心脏起搏器1500余台，手术无一例失败，手术操作时间最短仅15分钟。在成都地区最早开展心律转复除颤器（ICD）植入技术。

心内科介入专家。中华医学会心脏起搏专业委员会第一、二届委员，中国中青年心律失常研究会第二届常委，原成都军区心脏起搏中心主任、成都军区心血管专业组副组长、解放军47中心医院（现成都医学院第一附属医院）副院长。成都心血管病医院心脏介入中心主任。

已发表论文30余篇，获得军队和省级科技奖15项，组办全国性学术会议5次，曾应邀到十余个国家参加国际性学术会议和学术交流。

90年以来，已为700余例风心病二尖瓣狭窄、主动脉瓣狭窄，先天性肺动脉狭窄的病人进行了经皮穿刺球囊扩张术，免除了开胸手术之苦，成功率达99%以上。并为50余例巨大左心房、有附壁血栓，严重二尖瓣狭窄但已失去开胸手术时机的晚期风心病患者，成功地施行了球囊扩张术。在西南地区最早开展电消融治疗心动过速技术，92年后又将射频消融技术应用于临床，使患有预激综合征、房室结双径路等引起的心动过速得到根治。2004年又开展了先心病动脉导管未闭、房间隔缺损、室间隔缺损的导管法封堵和冠状动脉造影、球囊扩张、支架植入等心脏介入技术。孙建昌主任还经常应邀到省内外医学院校、省地市县级医院协助开展心脏介入性技术和处理疑难复杂病例。