从事普通外科、肝胆外科临床工作20多年，对肝脏、胆道、胰腺、脾脏等器官疾病的外科诊断治疗有丰富的临床经验，尤其擅长腹腔镜微创肝胆外科手术(包括腹腔镜微创保胆囊取石、息肉术/腹腔镜胆囊切除、胆总管切开取石、T管引流术/腹腔镜肝部分切除术/腹腔镜脾脏切除术/腹腔镜肝囊肿开窗引流术等)，是南方医院最早开展腹腔镜微创肝胆外科手术的医生。

1984年毕业于第二军医大学军医系（本科）。1987年～1990年在第二军医大学就读研究生，获医学硕士学位，师从著名外科专家仲剑平教授。2000年晋升为副教授、副主任医师。

获广东省科技计划项目基金1项（项目负责人）。获中国人民解放军医疗成果二等奖1项。获南方医院医疗成果奖7项。获第一军医大学教学优秀奖3等奖1项。在国内外刊物上发表专业论文60多篇。副主编《胆管癌的基础与临床》。                                                                学术任职                        目前是广东省医学会微创外科分会普通外科学组副组长，广东省肝脏病学会肝癌专业委员会常务委员，广东省医师协会肝病专科医师工作委员会委员。

近五年在国内外学术期刊上发表SCI论文40余篇，其中包括Hepatology、Science、JI等著名杂志。

目前是广东省医学会微创外科分会普通外科学组副组长，广东省肝脏病学会肝癌专业委员会常务委员，广东省医师协会肝病专科医师工作委员会委员。

近年来获得国家杰出青年基金、国家自然科学基金重点项目、国家973子课题项目等国家级项目5项，其它省部级以上项目8项。2009年初，侯金林教授作为首席科学家的国家十一.五重大传染病防治项目慢性乙型肝炎的优化抗病毒治疗正式启动，该项目获得国家7800多万元的资助。