包茎术后系带长肉粒且伴有轻微疼痛可能是术后并发症，如血肿机化、瘢痕增生等。

包茎术中需切开包皮内板及阴茎头前部黏膜，此时可能会有少量出血，血液积聚在阴茎头部可形成血肿。血肿机化过程中，新生血管会进入血肿内部，促进其液化坏死，并逐渐被周围结缔组织替代，形成肉芽肿样改变。此外，在伤口愈合过程中，体内的成纤维细胞会迁移到伤口处进行修复，如果过度活跃可能导致瘢痕增生。以上这些因素都可能导致系带部位出现肉芽肿或瘢痕组织，从而表现为小肉粒状突起。

若患者存在局部感染，也可能会导致术后系带出现炎症反应，引起红肿、疼痛等症状，进而可能伴随有肉粒形成。这种情况通常需要抗生素治疗，如口服罗红霉素胶囊、阿莫西林胶囊等。

术后应避免剧烈运动，以免影响伤口愈合，同时注意个人卫生，保持患处清洁干燥，以减少感染风险。