上海市第五人民医院创建于1904年为工部局所建的“西人隔离医院”1939年由日本同仁会接办改称“同仁会医院”1945年收归国有定名为“上海市市立第五医院”1949年上海解放更名为“上海市市立第五人民医院”1960年迁至闵行一度又称“上海市闵行区中心医院”“上海市工农医院”1984年经批准恢复“上海市第五人民医院”院名1995年原闵行区传染病医院并入1998年闵行区人民政府和原上海医科大学联手共建市五医院随着原上海医科大学与复旦大学合并为新的复旦大学现医院又称“复旦大学附属上海市第五人民医院”
　　医院目前占地5.81公顷（约90亩）建筑面积6万平方米医院核定床位604张年门急诊量超过70万人次年住院病人超过1.4万人次住院病人手术超过6,000例次；现有职工1,000余人专业技术人员900余人其中高级职称百人硕博士46人医院现拥有上海市百人计划1名上海市曙光学者1名上海市医苑新星1名上海市区县百人计划4名闵行区卫生系统学科带头人14名；有6人享受国务院特殊津贴
　　作为复旦大学附属医院和蚌埠医学院皖南医学院教学医院医院每年承担五所院校临床公卫等七个专业200余人的教学任务拥有授课教授和兼职教授60余人医院每年发表学术论文约200篇约1/3在国内核心和权威期刊上发表部分在国外期刊中发表也有一些有IFSEISCI指数的文章
　　医院现有万元以上设备600余件拥有重症监护（ICUCCU）全国一流的高压氧舱MRI16层CTECTDSA800MA的大型X光机数字胃肠机C臂介入X光机全身及脑部彩色超声诊断仪血液透析腹腔镜关节镜电子内镜系统碎石机全自动生化分析仪超声乳化仪玻璃体切割器眼科电脑视野仪多种激光治疗仪等大型医疗仪器设备直线加速器也正在配置中医院资产总值达3.5亿元其中设备总值8000余万元医院现能开展全膀胱切除-原位新膀胱术腹腔镜胆囊切除肾囊肿切除术及腹腔镜手术治疗宫外孕人工心脏起搏器安装心脏间隔缺损封堵术射频消融术冠脉造影及安置支架人工晶体植入喉再造等难度高技术新的手术良好的医疗环境优质的医疗服务使群众对医院满意率达到94%医院连续四次被评为上海市文明单位
　　医院从建院之初的8个临床科室150张床位的条件下努力发展学科建设陆续开设了绝大部分二级和三级学科迄今已基本齐全设有内科（分设呼吸心血管消化肾脏神经内分泌血液感染与风湿病等分科）普外科胸外科神经外科泌尿外科妇产科儿科骨科中医科老年科肿瘤科传染科急诊科麻醉科眼科耳鼻喉科口腔科皮肤科保健科职业病科高压氧科理疗科检验科核医学科放射科（含放射介入和放射治疗科）药剂科超声医学科病理科营养科等37个专业科室其中泌尿外科和中医支气管炎专科是上海市医学特色专科；眼科耳鼻喉科病理科儿科新生儿专业心内科呼吸科和骨科是闵行区医学特色专科；高压氧舱治疗为国家级和上海市继续教育项目各科室积极开展新技术新项目有较好的抢救重危病人水平
　　医院现为上海市西南郊规模最大设备较齐全技术力量较强服务范围较广泛的一所综合性教学医院

连续四次被评为上海市文明单位