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成立于1994年，当时床位10张。1996年批准为硕士学位授权学科，2002年批准为博士学位授权学科。现科室开展床位60张，病房目前位于和田路64号(长征医院诊疗分部)，有各类人员26名，其中高级职务2名。

历任主任：王杰军;历任副主任：许青。

从成立之日起，即致力于恶性肿瘤的早期诊断、综合治疗、抗肿瘤转移及姑息治疗等的临床和基础研究，并取得了较大的成绩。尤其在消化道肿瘤、肺癌以及骨肉瘤等恶性肿瘤的早期诊断和早期复发或转移的诊断及治疗方面，吸收并引进了国际间一系列研究结果和最新理念，结合中国人种的特点，给予此类病人最有效、合理的化疗及最有效的手段来改善病人的生活质量，并在最大程度上延长病人的生存期。该科在改善肿瘤病人生活质量方面取得了很多临床及技术方面的成果。2003年10月起引进了肿瘤微创治疗，包括热疗、组织间放疗及氩氦刀。先后获得军队科技进步一等奖1项，军队医疗成果二等奖、三等奖各1项，国家、军队、上海市10项基金资助。与军事医学科学院合作承担了国家“863”课题——《树突状细胞治疗恶性肿瘤》，并成立了符合国家GLP标准的实验室。主编参编专著5部。发表论文40余篇。担任上海癌症康复和姑息治疗委员会主任委员、中国癌症康复和姑息治疗委员会副主任委员、国家药品监督管理局药物审评委员会委员、解放军肿瘤研究所副所长、上海肿瘤学会副主任委员、上海市综合性医院肿瘤专题组副组长。