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首都医科大学附属北京友谊医院临床检验中心是集医、教、研、防于一体的综合性、现代化实验室，通过了国际标准化组织ISO15189:2003《医学实验室-质量和能力的专用要求》的认可，是北京市临床检验中心微生物组所在地。 　　临床检验中心拥有现代化检验设备、国际先进的物流传送系统、实验室信息管理系统和高素质检验人员，为临床和病人提供300多项检验项目，2007年工作量为1191万件。设有临床检验实验室、血液学检验实验室、免疫学检验实验室、微生物检验实验室、生化检验实验室和分子生物学实验室。定编工作人员61人，其中硕士研究生导师2人，正高级职称3人，副高级职称6人，博士生1人，在读博士2人，硕士生7人。实验室使用面积1500余平方米，检验设备总价值4500余万元。 　　生化实验室开展的免疫电泳检测，血液室开展的染色体分型，微生物实验室开展的难辨梭菌毒素检测、肠道菌群分析等项目在北京市临床检测项目中均具特色。 　　临床检验中心致力于检验质量管理体系的建立与应用，并努力与国际水平接轨。实验室信息管理系统的网络建设和使用在北京市位于前列。自1983年以来负责北京地区157家，包括50家三甲医院的临床微生物室间质评工作。5个专业组均参加了卫生部和北京市临床检验中心的室间质评活动，近5年的室间质评成绩均为优秀。2005年，临床检验中心成为北京市属医院中获得美国CAP能力验证荣誉证书的第一家实验室。 　　先后承担北京市自然科学基金、出国留学回国人员科研资助项目、局级项目和院校级项目等多项科研项目，获得过北京市自然科学基金二等奖、中华医学科技奖三等奖和检验学会三等奖等奖项，近五年发表统计源论文100余篇，出版专著2部。 　　近两年，举办国家级继续教育项目2项，获首都医科大学精品课程和校长基金各一项，编写的教材获首都医科大学优秀教材二等奖，多次获得首都医科大学优秀教研室称号。作为北京市检验专业住院医师培训基地，每年还接收全国各医院进修人员20余人。 　　临床检验中心的质量方针是“以人为本、仁爱博精、科学高效、满意放心”。检验工作的最终目标是：在病人和家属满意、临床满意、社会满意基础上达到自身满意。